Установлен этот праздник в 1992 году постановлением Архиерейского собора «О совершении празднования памяти новомучеников 25 января по старому стилю в случае совпадения с воскресным днем, если нет, то в ближайшее воскресенье». 20 августа 2000 года в храме Христа Спасителя состоялся чин прославления всех мученически пострадавших за веру Христову, как известных, так и неизвестных. В настоящее время число поименно прославленных новомучеников составляет более 1700 человек. В 2002-2008 гг. к лику новомученников и исповедников Церкви Русской по представлению Йошкар-Олинской и Марийской епархии причислены епископ Леонид (Антощенко), протоиереи Адриан Троицкий, Сергий Стрельников, Николай Рюриков, священники Михаил Березин и Анатолий Ивановский.

В нашей епархии в честь новомучеников и исповедников Церкви Русской освящен храм в городе Волжске и нижний храм церкви в честь иконы Божией Матери «Державная» поселка Медведево. В день праздника 9 февраля архиепископ Йошкар-Олинский и Марийский Иоанн совершил в медведевском храме Божественную литургию. Владыке сослужили настоятель храма иерей Алексий Михайлов и клирик иерей Алексий Добиков. После Литургии был совершен молебен и крестный ход.